Krajské volby 2012 proběhly 12. a 13. října. Josef Babka se umístil v pořadí podle preferenčních hlasů na 2. místě po Miroslavu Novákovi z ČSSD. Josef Babka za KSČM získal 5547 hlasů. Volby vyhrála ČSSD a na druhém místě se umístila KSČM s 22,78 procenty hlasů
Josef Babka se stal lídrem kandidátní listiny KSČM pro krajské volby 2012 a rovněž kandidátem na hejtmana Moravskoslezského kraje. Pokud bude zvolený, nahradí současného hejtmana Jaroslava Palase z ČSSD. Ten svou funkci obhajovat nebude.
Doposud působil jako člen Rady Zastupitelstva Moravskoslezského kraje, kde zastává funkci předsedy Komise bezpečnostní a pro integrovaný záchranný systém a předsedy Klubu zastupitelů za KSČM. Je také členem Zastupitelstva města Ostrava, kde je předsedou Komise právní, členem Statutového výboru a předsedou Klubu zastupitelů.
Je ženatý, má tři děti.
