Pražská Thomayerova nemocnice poskytuje komplexní lékařskou a ošetřovatelskou péči. Na začátku roku 2012 přišla o status "fakultní", stále však spadá pod ministerstvo zdravotnictví.
V současné době má Thomayerova nemocnice zhruba 1 600 lůžek a přibližně stejný počet zaměstnanců, z toho asi 1 100 zdravotnických pracovníků.
Ředitelem je Karel Filip.
Součásti nemocnice je i samostatná porodnice s kojeneckým ústavem, léčebna dlouhodobě nemocných, dětský domov.
V areálu se nachází i organizačně a ekonomicky zcela samostatné zdravotnické zařízení, jímž je Institut klinické a experimentální medicíny.