Sigma Olomouc patří k tradičním účastníkům české nejvyšší fotbalové soutěže, dnes pojmenované Gamrinus liga.
Historie fotbalové Sigmy se datuje do roku 1919, kdy v hanácké metropoli vznikl klub pod názvem FK Hejčín. Do organizované soutěže vstoupil v roce 1924. Po roce 1948 došlo ke sloučení několika hejčínských celků a v dalších letech k opakovaným změnám názvů. Pod jménem Spartak Moravské železárny Olomouc pak tým střídavě nastupoval v divizi a krajském přeboru, postup do druhé ligy si pod názvem TJ Moravské železárny Olomouc vybojoval až v roce 1963.
Evropská léta
Dalším mezníkem pro klub se stal rok 1966, kdy do něj vstoupil silný ekonomický partner Sigma, který přinesl i postupný výkonností vzestup. Postup z divize se však týmu podařil až v roce 1974, kdy v něm působil pozdější trenér Olomouce Karel Brückner. O dva roky později Sigma vstoupila do I. české národní ligy, v té době za ní hrávala další slavná jména olomoucké kopané - Petr Uličný nebo Milan Máčala. První postup do nejvyšší soutěže pak přišel v roce 1982. Za rok pak sice následoval pád, ale v následující sezóně se Hanáci mezi elitu opět vrátili.
Po převratu v roce 1989 se fotbalový oddíl stal v rámci tělovýchovné jednoty dominantní složkou a ruku v ruce s tím přišel další výkonnostní progres. V té době hrávali v olomouckém dresu hráči jako Lauda, Beznoska, Drulák či Přiložný. Největších úspěchů dosáhla Sigma pod vedením Karla Brücknera v sezónách 1992/1993 a 1993/1994, kdy nastupovala v Poháru UEFA (v druhém případě vypadla až ve čtvrtfiánle s Realem Madrid). Tehdy olomoucké barvy hájili například Luboš Přibyl, Jan Maroši, Radoslav Látal, Pavel Hapal, Roman Kerbr, Roman Hanus nebo Jiří Barbořík. Období "evropského" působení pak ještě chvíli pokračovalo a bylo završeno finálovou účastí v Poháru Intertoto v sezóně 2000/2001, o který se zasloužili například Stanislav Vlček, Radim Kučera nebo David Kobylík.
Líheň talentů
Olomouc je pověstná svojí precizní péčí o mládež, proto z její líhně mohli vyjít hráči jako Tomáš Ujfaluši, David Rozehnal, Radoslav Kováč, Marek Heinz, Roman Hubník, Tomáš Kalas, Tomáš Hořava nebo Tomáš Přikryl. Největších domácích úspěchů dosáhla Sigma v devadesátých letech, kdy skončila v nejvyšší soutěži čtyřikrát třetí (sezóny 1990/91, 1991/1992, 1997/1998, 2000/2001) a jednou druhá (v sezoně 1995/96), v sezóně 2010/2011 se také probojovala do finále národního poháru. Olomou patří tradičně k předním klubům ligy a sympatie fanoušků si v poslední době získává především svým ofenzivním pojetím fotbalu.
Jednu z největších krizí v dějinách olomoucké kopané však klub zažívá v těchto dnech (sezóna 2011/2012), kdy se musel vypořádat s odpočtem devíti bodů za korupční aféru s celkem Bohemians Praha. Trest, spolu s ne příliš povedenou podzimní částí sezóny, odsoudily Sigmu k boji o záchranu. K ní by jí měl pomoci staronový kouč Petr Uličný, který má v zádech sportovního manažera Jana Gottvalda, a do pole mu přibyli například Jakub Podaný ze Sparty nebo navrátilec Michal Ordoš.
Po podzimní části sezóny 2011/2012 se Sigma nachází na 15. místě tabulky.
