Václav Hampl byl od roku 2006 rektorem Univerzity Karlovy v Praze (UK). Ve volbě zvítězil nad nad někdejšími děkany 1. lékařské fakulty Štěpánem Svačinou a 3. lékařské fakulty Michalem Andělem. V roce 2010 byl zvolen do druhého funkčního období, které mu skončilo v lednu 2014. Jeho nástupcem je Tomáš Zima, který byl sedm let děkanem 1. lékařské fakulty.
Před svým rektorováním byl Václav Hampl předsedou Akademického senátu UK. Spolu s rektorstvím zatsával úlohu předsedy České konference rektorů, která oponuje návrhy na reformu vysokého školství ČR ministra Dobeše.
Vědeckou specializací přírodovědce profesora Hampla je fyziologie; zabýval se plicními cévami na univerzitě v Minessotě. Specializuje se na problematiku plicní hypertenze.
Vystudoval Přírodovědeckou fakultu UK. Kromě profesorského titulu je držitelem hodnosti DrSc. - doktor věd. Je ženatý a má tři děti.